滁州市加快推进农业标准化体系建设，创建优质农产品基地，实现农产品质量安全水平的明显提升。目前，该市有效使用绿色食品标志产品达到163个、有机食品标志产品达到20个，绿色食品监控面积204.7万亩，年产量达93万吨，绿色食品认证总数位居全省第一。

自2006年起，滁州市政府每年安排专项资金支持建设20个优势农产品标准化生产示范基地，引导农民标准化生产。该市选择种植、畜牧、水产和蔬菜四大主导产业的13个具有一定规模、在市场上有较强竞争力的农产品，共建立242个农产品标准化生产基地、40个畜禽标准化养殖小区、31个水产健康养殖示范区，其中省级示范基地(区)12个。

滁州市还出资支持农民专业合作社建设，提高农民组织化程度，每年对新申报成功的无公害农产品、绿色食品、有机食品分别给予扶持奖励。与此同时，大力推广植保无害化防控技术、测土配方平衡施肥技术，实施乡村清洁工程，控制农业面源污染，加强产地环境监管有效保护了农业生态环境。